复旦大学附属肿瘤医院肿瘤妇科创建于1959年，是我国最早成立的专门诊治妇科恶性肿瘤的临床科室，由来自放射治疗科王琪和蔡树模、肿瘤外科张志毅和吴百生、以及妇产科医院刘淑香等教授组成，形成放疗、手术、妇产科以及后来化疗生物靶向融为一体的多学科综合治疗模式，一直沿袭至今并发扬光大，成为科室的核心竞争力。2005年成立了复旦大学肿瘤医院妇科肿瘤多学科综合治疗团队，科主任吴小华教授任首席专家至今。目前是教育部“985平台”肿瘤学重点建设发展学科，上海市女性肿瘤重点专科、中国抗癌协会卵巢癌专业委员会主任委员单位。

      科室目前有医师49人，手术床位150张，另设有独立妇科放疗的妇科治疗室。已完成了500余例经腹根治性宫颈切除术（ART），成为世界上数量最多的宫颈癌保留生育手术单中心， 5年生存率达98.6%，提出的保留生育功能ART手术的“复旦标准”被2015年NCCN指南引用并推荐至今。每年手术治疗卵巢癌患者近2000例，晚期卵巢癌减瘤术切净率（R0）达77.8%，5年总生存率为49.7%。建立了“卵巢癌诊疗全程管理模式”，形成遗传风险评估与干预措施、二次减灭术标准、腹膜后淋巴结切除术范围等临床特色。晚期宫颈癌的精准放化疗后装治疗及插植放疗亦是科室特色技术，并拥有疑难手术丰富经验，如卵巢癌多脏器切除术、外阴癌转移皮瓣修复、宫颈癌除脏术等。此外，科室也成为国内罕见妇科肿瘤如外阴癌、阴道癌、肉瘤以及恶性黑色素瘤诊疗中心。据《上海市市级医院医疗质量评价与促进平台》统计， 2023年收治妇科三大恶性肿瘤根治术手术量均位列上海市第一，住院费用远低于市平均水平。

      临床研究立项170余项,其中牵头国际/国内多中心临床研究项目62项。吴小华教授牵头编写NCCN妇科肿瘤指南中国版、CACA中国妇科肿瘤整合诊治指南。获中国抗癌协会科技奖一等奖、上海市科技进步奖等奖项。每年有60余名进修医生前来学习，也吸引了美国和韩国的fellow前来培训，是复旦大学妇科肿瘤的博士后、博士和硕士研究生培养点，为我国培养了大批妇瘤专科医生。