复旦大学附属肿瘤医院对肿瘤组织标本进行转录组测序项目 院内谈判公告

复旦大学附属肿瘤医院对肿瘤组织标本进行转录组测序项目

院内谈判公告

一、项目基本情况

项目编号（院内编号）：WXSQD202207060015

项目名称：对肿瘤组织标本进行转录组测序

采购方式：√谈判 □磋商 □询价

预算金额：15.89万

最高限价：（预算金额，第一次报价不得高于预算）

采购需求：

一、投标人具备资格

一、              产品清单

二、技术参数

1.利用Illumina NovaSeq 6000 测序平台转录组测序，每个样本提供6G raw data数据，最低数据量不少于承诺数据量的98%；

★2. 生物信息分析：提供交互式分析，下载分析结果等操作

自由调节分析参数，一键化出图并线上修改；

3. 对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理；

3.1 数据产出统计及测序数据的成分和质量评估

3.2参考序列比对分析

4.可变剪切分析

5.新转录本预测

6.SNP/InDel变异位点分析

7.基因表达定量分析：样本基因表达量小提琴图，箱线图、基因表达饱和度曲线、样本间PCA分析

8.样本间基因表达量的相关性分析

★9.基因差异表达分析：差异表达基因的聚类热图、差异表达基因集之间的Venn图，UpSet图、差异表达基因的GO ORA富集分析、差异表达基因的KEGG ORA富集分析、GO GSEA富集分析、KEGG GSEA富集分析、富集条目语义相似性分析

★10.差异表达基因的蛋白质互作网络分析、差异表达基因中的转录因子鉴定、WGCNA共表达网络分析

10.    质保：使用期限为3年

11.    交货期：

11.1样品制备：在收到样本及信息单的次日起计算，5-10个工作日完成RNA抽提和质检工作（样本较多时，抽提和质检时间会有所加长），并将质检报告发送给甲方。

11.2 Illumina测序：如果所有样本都合格，将对合格的样品直接安排建库测序，15个工作日完成文库构建和测序工作。如有不合格样本，双方沟通是否重新送样或者重新提取样本，以确认下一步的实验。

11.3 生物信息学分析：测序工作完成后15-20个工作日得到分析结果。

本项目不接受联合体。

二、报价单和资质文件提交

所需材料：见附件。

注：单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商，不得同时参加本项目采购活动。参与本次采购活动的供应商之间有上述关系的，应主动声明，否则将给予列入不良记录名单、3年内不得参加本单位组织的采购活动的处罚。报价单位近三年内在经营活动中没有违法记录；报价单位未被“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）列入失信被执行人名单、重大税收违法案件当事人名单，且未被“中国政府采购网”（www.ccgp.gov.cn）列入政府采购严重违法失信行为记录名单。

截止时间：2022年11月3日15点（北京时间）

地点：上海市徐汇区东安路270号

三、报名时间（需提前和采购人联系）

截止时间：2022年11月3日15点（北京时间）（从谈判文件开始发出之日起至供应商提交首次响应文件截止之日止不得少于3个工作日）

资料开标时，带至现场。

地点：东安路徐汇院区

四、开标及评标时间

时间： 后续会进一步进行通知（北京时间）

地点：东安路徐汇院区

五、公告期限

自本公告发布之日起3个工作日。

六、其他补充事宜

无

七、凡对本次采购提出询问，请按以下方式联系。

1.报名方式（请先与项目联系人联系）

名    称：复旦大学附属肿瘤医院　

地    址：上海市徐汇区东安路270号

联系方式：64175590*83318 

联系人：马佳雯

2.项目联系方式

项目联系人：胰腺外科

      电　　 话：64175590*胰腺外科

医院谈判所需资料清单及要求.docx

公司承诺书20220915(1)(1)(5).pdf