招标采购

复旦大学附属肿瘤医院乏氧临床试验肿瘤样本多重免疫组化检测项目院内需求论证

发布日期:2024年01月09日 点击数量:3408次

项目名称:乏氧临床试验肿瘤样本多重免疫组化检测项目

项目编号:WXSQD202312260001

预算:110.9万(以正式招标公告为准)

 

一、             产品清单

技术服务名称

单位

数量

技术服务简介

肿瘤样本多重免疫组化检测

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在同一个肿瘤FFPE样本上进行多个不同生物标志物的标记,达到对单个生物标志物或者多个生物标志物共定位分析,从而实现对肿瘤微环境的评估。

 

二、技术参数

1. 行业内专业技术服务资质:

技术服务参数:

(1)       多重免疫组化检测分为两个不同的panel组合:

Panel 1CD33, CD68, HIF-1α, HIF-2α, HLA-DR, CD163

Panel 2CD3, CD8, FoxP3, panCK, HIF-1α, HIF-2α;

(2)       每一例样本进行HE染色,并由病理医生进行样本质量评估:判断组织是否有坏死并划出,判断是否有肿瘤细胞并划出肿瘤区域和间质区域;

(3)       多重免疫组化标记样本以全切片扫描模式进行图像采集:

标记所用7个荧光探针激发波长为:380nm-400nm / 410nm-440nm / 480nm-500nm / 520nm-545nm / 585nm-605nm / 655nm-675nm / 730nm-760nm

标记所用7个荧光探针发射波长为:410nm-440nm / 475nm-505nm / 520nm-546nm / 560nm-581nm / 625nm-650nm / 700nm-725nm / 775nm-860nm

采集原始数据分辨率不低于0.35-0.4 μm/pixel

4  样本扫描参数可追踪,可在原始数据中保存扫描参数如扫描时间点、扫描倍率、扫描通道及各通道曝光时间、扫描分辨率等;

5  提供免费原厂原始数据浏览软件用于图片和浏览和调整;

6  浏览软件可以更改各个通道配色并进行图像亮度和背景荧光的过滤;

7   浏览软件可以打开多个图像浏览时可同步移动多个图片进行浏览分析;

8  浏览软件可以在图像上添加注释,可以在图像上进行长度测量、面积测量;

9   浏览软件可以对数字切片图像的指定区域范围进行输出,格式保持不变;

10  浏览过程中,浏览软件可在扫描倍数下以任意倍数显示,并且显示标尺、放大倍数;

11  浏览软件可以360°旋转图片进行浏览;

12  *分析软件必须具备组织分型带AI功能的区域分割模块,免疫荧光细胞定量模块和空间分析模块;

13  分析软件可进行图像注释:自由选定组织区域进行分析或删除不分析区域,在分析时可剔除染色杂质、撕裂、气泡、褶皱等区域;支持同时定义多个不同的注释层,不同注释层之间分析结果相互独立;可批量对所圈注的注释区域图层颜色、名称进行修改以及进行删除、掩藏等操作;支持对注释区域添加备注;

14  分析软件具备实时窗口预览:提供结果实时预览窗口,实时展现分析结果,实时对参数进行调整;

15  组织分型:提供基于深度学习人工智能算法(U-net/Deep lab/FCN-8s

等)的组织分型功能,根据组织的染色、纹理、形态等进行圈选训练识别,提供组织结构的识别及分析(如肿瘤、间质、坏死);提供根据组织分型的准确度提供热图图示,并可在组织分型后在某一组织类型中直接进行细胞/对象的定量分析;

16  单细胞识别:提供基于深度学习人工智能算法(U-net/Deep lab/FCN-

8s等)的细胞识别模块或根据细胞形态进行训练识别精确的识别单细胞,也可根据提单细胞的形态学数据,包括细胞面积、胞核、胞浆面积、周长、圆度值、细胞核//浆完整度、染色分级、平均光密度以及在组织图像上的X/Y轴空间位置信息;可鉴别复杂组织样本中的单个细胞及细胞亚结构(细胞核、质、膜)形态数据,可进行粘连细胞、细胞碎片杂质排除;

17  免疫荧光细胞定量:可同时量化细胞核、细胞膜、细胞浆中免疫荧光标记物表达。可计算出无限种荧光标记物当中每种荧光标记物的细胞个数以及百分比,可根据荧光强度对细胞按照弱、中、强(1+2+3+)进行细胞分级,并可同时定量双阳、三阳(按照细胞阳性、阴性对多种不同细胞表型进行组合)等各种细胞表型分析;对于异质性表达的抗体,如胞核、胞浆同时表达,可针对各个细胞区室表达的细胞进行识别;

18  *空间关系分析:可分析不同细胞之间的邻近关系、细胞与组织之间的浸润程度等组织原位的空间分布特征,并可自动生成虚拟的空间分布图示以及统计直方图示。具备细胞邻近度分析功能,计算某一细胞亚群在一定范围内最近邻的其他细胞亚群的数量及两者之间的距离;具备细胞最近邻分析,用于识别某一细胞/对象最邻近的其他细胞/对象的数量及平均距离或自定义距离;具备浸润程度分析,计算感兴趣的注释边界一定范围内细胞/对象的数量、密度等;

19  算法模版设置:可针对某种组织类型、染色类型进行算法模版设定,利用与后续同批次及同类型的组织样本的定量分析;

20  数据备份:支持分析算法、图像注释,分析结果手动或根据需要定期自动备份;

21  数据导出:支持导出图像分析过程中的注释、分析算法以及分析后的图示;支持生成“.csv”文本文件、word报告文件;支持以TIFPNG等格式生成分析前、分析后的组织图示数据。

 

交付期限:

样本到位后2个自然月内完成。

 

交付形式:

提供原始数据、基础分析数据及实验报告

 

三、     绩效参数

1、 使用方满意度≥90%

2、 原始数据交付率100%

      如有意者请于2024.01.1.17:00之前与后勤服务科取得联系 联系人:袁鹤鸣。联系电话:18017317242